莱比锡市政厅广场后面一个静静的街角上，耸立着巴赫曾经主持了27年之久的托马斯教堂合唱团（Thomanerchor）教堂，教堂始建于13世纪，曾经是一座修道院，属于晚期歌特式建筑，从1702年演变成今天的样子。现在的托马斯教堂也是在二战后重建的，巴赫的遗骸就被安放在这里。从1723开始年直到大师逝世（1750年），巴赫担任了这里的管风琴师兼合唱团指挥，他一生中最重要的创作始光就是在这里度过的，并且在这时诞生了《马太受难曲》等许多名曲。
巴赫的墓地在教堂内主祭坛前面（入口向右的尽头）。大师一生奉献给了音乐，死后也沉浸在永恒的创作中——教堂内部用当年托马斯合唱团的古乐器作装饰。哥特式窗户的彩色玻璃上描绘的是马丁·路德、巴赫和第一次世界大战中的死难者。当一束阳光透过逼仄的彩窗，照射到镌刻着约翰-塞巴斯蒂安-巴赫（Johann Sebastian Bach）名字的青铜棺盖上面的时候，那些暗红色的大提琴或者是残破的皮鼓突然像是有了生命一般，莹莹地闪着光芒。
教堂庭院的巴赫雕像旁的商店里可以找到有关巴赫和托马斯教堂的资料。如果没有团体参观，在周五的傍晚和周日的清晨，你都可以观看到托马斯唱诗班（(Thomaner Chor)）的合唱练习。